Die Meraner waren schon immer gute Flugballer seit der Sektionsgründung 1946. Der Flugballplatz war im Meraner "Lido", wo Hans Masten, Dr. Luis Gutweniger und andere täglich spielten, während Kurt Brantsch mit seiner Gruppe in der Lazag einen Spielplatz errichtet hatte. Später schlossen sie sich zusammen und spielten im Schwimmbad. Unter der Leitung von Kurt Brantsch wurde 1960 die Sektion Flugball Herren gegründet und ab 1961 begann der Wettkampf.

Auf Kurt Brantsch folgten im Verlauf der Jahre Willy Rainer, Dr. Toni Holzgethan, Reinhard Zipperle, Bruno Giovannini, Ing. Hansjörg Fischer, Florian Ellmenreich, Armin Hölzl und Michael Seibstock.

Auch die Damen hatten eine eigenständige Sektion, die von Martha Ellmenreich als erste Sektionsleiterin betreut wurde. Erst später wurden die beiden Sektionen zusammengelegt. Nach dem Tode von Michael Seibstock im Jahr 2013 und noch Roberto De Checchi bis 2018 ùbernahm Freund Karl die Führung der Sektion.